Der Widerstand hat eine wirksame Waffe gegen die Besucher aus dem All gefunden: Bakterien. Die Krankheitserreger sind für Menschen ungefährlich, aber töten die Aliens in kürzester Zeit. Die Rebellen planen ihre letzte große Offensive gegen die außerirdischen Invasoren. Dabei müssen sie unbedingt verhindern, dass Diana und John zur Endlösung greifen: eine thermonukleare Sprengung. Unter großen Gefahren dringen Mike und Martin in das Mutterschiff vor.